高效液相色譜系統采用一種區別于經典液相色譜，基于儀器方法的高效能分離手段，具有高壓、高效、高速、高靈敏度、高選擇性等特點。
高效液相色譜系統采用的相色譜法與反相色譜法不同點：
正相色譜法反相色譜法固定相極性高～中中～低流動相極性低～中中～高組分洗脫次序極性小先洗出極性大先洗出
從上表可看出，當極性為中等時正相色譜法與反相色譜法沒有明顯的界線(如氨基鍵合固定相)。
按分離過程的機理分為吸附色譜、分配色譜、離子交換色譜和體積排除色譜。
吸附色譜(Absorption Chromatography)：根據樣品組分對活性固定相表面吸附親和力的不同實現分離。
分配色譜(Partition Chromatography)：分離基于樣品組分在固定相和流動相中的溶解度(分配系數)不同。
離子交換色譜(Ion Exchange Chromatography)：根據樣品組份離子交換親和力的差異分離,簡稱離子色譜(IC)。
體積排除色譜(Size Exclusion Chromatography)：分為GPC和GFC。
GPC(Gel Permeation Chromatography凝膠滲透色譜又稱尺寸排阻色譜)：固定相是疏水性凝膠,流動相是水或緩沖溶液-有機溶劑。
GFC(Gel Filtration Chromatography凝膠過濾色譜又稱水系凝膠色譜)：固定相是親水性凝膠,流動相是水或緩沖溶液。
